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硅-罗丹明是用二甲基硅基替换四甲基罗丹明母核中的氧原子得到的一类具有更长发射波长、更好光稳定性的荧光染料、以及标记时更低荧光背景的荧光染料。SiR 染料大激发波长 652 nm，大发射波长 674 nm，处于红外光区；光稳定性好，成功应用于超高分辨成像；在溶液中常处于闭环状态，因而标记时荧光背景非常低。将 SiR 羧酸与各种点击化学接头连接，我们开发了一系列的 SiR-Click 探针，用于生命科学相关研究。
在众多有机小分子荧光骨架中，硅基取代罗丹明凭借其高亮度、高稳定性成为STED成像技术中运用较为的探针之一
荧光探针是生物学的重要研究工具。利用化学的手段调节荧光团的性质可将染料基于特定的应用场景进行微调。其中荧光素和罗丹明染料作为生物探针具有优异的性能1-2。氧杂蒽荧光探针被应用主要基于其两个特性：高荧光的两性离子形式和无荧光的内酯形式之间的平衡；通过拓宽共轭或氧原子的取代对光谱特性进行微调的能力。
SiR-alkyne 硅基罗丹明-炔基
SiR-azide 硅基罗丹明-叠氮
SiR-BCN 硅基罗丹明-环丙烷环辛炔
SiR-COOH 硅基罗丹明-羧基
SiR-Maleimide 硅基罗丹明-马来酰亚胺
SiR-NHS ester 硅基罗丹明-琥珀酰亚胺酯
SiR-tetrazine 硅基罗丹明-四嗪
SiR-Me-tetrazine 硅罗丹明-四嗪荧光探针
SiR-DBCO 硅基罗丹明-二苯基环辛炔
SiR650-BG 硅基罗丹明-苄基鸟嘌呤
SiR700-BG 硅基罗丹明-苄基鸟嘌呤
SiR-PEG3-TCO 硅基罗丹明-三聚乙二醇-反式环辛烯
SiR-PEG4-alkyne 硅基罗丹明-四聚乙二醇-炔基
SiR-PEG4-azide 硅基罗丹明-四聚乙二醇-叠氮
SiR-PEG4-BCN 硅基罗丹明-四聚乙二醇-环丙烷环辛炔
SiR-PEG4-COOH 硅基罗丹明-四聚乙二醇-羧基
SiR-PEG4-Maleimide 硅基罗丹明-四聚乙二醇-马来酰亚胺
SiR-PEG4-NHS ester 硅基罗丹明-四聚乙二醇-琥珀酰亚胺酯
SiR-PEG4-tetrazine 硅基罗丹明-四聚乙二醇-四嗪
SiR-PEG4-DBCO 硅基罗丹明-四聚乙二醇-二苯基环辛炔
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